房屋登记于第三人名下时的确权问题，需依据具体情形及相关证据来判定。首先，要考量房屋的实际出资情况。若能证明是己方出资购买该房屋，即便登记在他人名下，也可作为主张权利的重要依据。其次，审查是否存在借名登记的约定。如有书面或其他形式可证明的借名协议，对确权有较大帮助。再者，房屋的占有使用情况也很关键。长期由己方占有使用房屋，可作为己方对房屋享有权益的佐证。在确权过程中，需通过收集各类证据来支撑自身主张。如出资凭证、购房合同、证人证言等。然后，可与登记名义人协商，要求其配合办理确权手续。若协商不成，可依法向人民法院提起诉讼，请求法院对房屋权属进行判定。法院会综合审查全案证据，依据事实和法律作出公正裁决，以确定房屋的真实权属状况。

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