农村厂房整栋出租是否合法需视具体情况而定。首先，要确认厂房建设是否符合相关规划与审批要求。若厂房建设经过合法审批，且用途符合当地农村土地利用规划，那么整栋出租在产权明晰的情况下通常是合法的。其次，需关注土地性质。如果土地是集体经营性建设用地，按照规定可以依法出租用于工业等经营性用途，整栋出租此类厂房一般具有合法性。但若是农用地，未经依法批准不得擅自改变用途用于非农业建设并出租厂房，否则属于违法行为。再者，租赁合同的签订也至关重要。合同应明确双方权利义务、租赁期限、租金支付方式等关键条款，确保符合法律法规规定，以保障双方合法权益。总之，农村厂房整栋出租合法性的判断，需综合考量厂房建设合规性、土地性质以及租赁合同等多方面因素，严格依据现行法律法规来确定，确保租赁行为在法律框架内进行。

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