违建房屋经开发后的赔偿归属问题较为复杂。首先，需明确违建房屋本身不受法律保护。但在其开发过程中，如果是因政府征收等合法原因导致开发，赔偿的确定要依据具体情况。若开发行为是基于公共利益等正当理由，且对违建房屋的拆除等行为符合法定程序，赔偿通常会综合考虑房屋的实际使用情况、相关权益人等因素来确定归属。一般而言，如果违建房屋是由合法权益人建设，在符合一定条件下，可能会给予适当补偿，补偿归权益人。比如虽房屋违建，但建房投入合理且长期实际使用，可能会酌情给予基于实际损失的补偿。然而，如果开发过程存在违法违规操作，如未经合法审批等，赔偿的合法性及归属就存在争议，可能需要通过法律程序来判定。同时，若存在多方对违建房屋有不同权益主张，需依据各方证据及法律规定来明确赔偿的最终归属，以保障合法权益，维护法律秩序和公平公正。

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