亲子鉴定结果显示99.9%的相似度，通常意味着亲生关系成立。亲子鉴定是通过对特定基因位点的检测与分析来判定亲子关系。当检测结果达到99.9%的相似度时，从统计学角度看，几乎可以确定存在亲生血缘关系。一般来说，亲子鉴定的准确率受多种因素影响。样本的采集、保存与送检过程需规范，以保证检测结果的可靠性。检测机构的技术水平、设备先进性以及操作人员的专业程度也至关重要。在严格遵循科学流程和标准的情况下，99.9%的结果能为亲子关系提供高度有力的证据。然而，理论上仍存在极其罕见的误差可能，但这种概率微乎其微。若对亲子鉴定结果有疑问，可考虑更换检测机构进行复查，或咨询专业法律人士，了解后续可能的处理方式及保障自身权益的途径。总之，99.9%的亲子鉴定结果大概率表明是亲生关系，但特殊情况需具体分析。

以上是律师的法律建议，如有疑问，欢迎进一步咨询。