厂房分割出售后通常需分别办理产权证。根据相关规定，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力。厂房分割出售意味着不同部分的产权归属发生了变化，各购买方需通过登记来明确其对相应分割部分厂房的所有权。办理分别的产权证有利于清晰界定各方权益，保障购买者的合法财产权。在办理过程中，一般需遵循特定流程。首先要确保厂房分割符合规划、土地等相关要求，满足办理产权登记的条件。然后，由买卖双方共同向不动产登记机构提出申请，提交包括分割协议、购房合同、身份证明等一系列必要材料。登记机构经审核无误后，将为各购买方分别办理产权证，使其获得具有法律效力的产权凭证，以维护其在厂房分割部分的权益，保障交易的合法性与稳定性。

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